E’ posta al centro della corte di Villanova, una corte molto antica e un tempo di proprietà delle monache di Santa Margherita, uno dei sette monasteri femminili di Milano.
L’impianto planimetrico è semplicissimo con navata unica e presbiterio entrambi a pianta rettangolare.

Le pareti sono tinteggiate ed affrescate con finte lesene dai capitelli pensili sormontati da trabeazioni e medaglioni raffiguranti immagini di santi. Centralmente alle lesene sono raffigurati, sulla parete di destra San Francesco d’Assisi mentre su quella di sinistra Sant’Antonio Abate. Alle spalle del tabernacolo è affrescata una delicata Vergine Assunta in cielo. Il solaio della navata è a cassettoni mentre la zona del presbiterio è coperta da una volta a crociera.

In corrispondenza della parete destra della navata è ancora presente una piccola apertura utilizzata dalle monache di clausura durante la confessione.
Il pavimento è stato recentemente rifatto avendo cura di ripetere l’identico sistema di posa originario.

La facciata è molto semplice, con tetto a capanna, un’unica porta centrale lunettata con scritta la dedicazione ed anticipata da tre gradini in pietra ed un unico soprastante dipinto raffigurante il Cristo.

Sulla destra il piccolo campanile con le campane suonate ancora a mano per mezzo di una fune.